Jednou z najnaliehavejších výziev, ktorým africké štáty čelia pri nezávislosti, bol nedostatok ich infraštruktúry. Európski imperialisti sa veľmi zasadzovali o to, aby priniesli civilizáciu a rozvoj Afriky, ale svoje bývalé kolónie nechali s infraštruktúrou málo. Impériá stavali cesty a železnice - alebo skôr prinútili ich koloniálne subjekty ich stavať - tieto však nemali slúžiť na budovanie národných infraštruktúr. Cisárske cesty a železnice boli takmer vždy určené na uľahčenie vývozu surovín. Mnohé, rovnako ako ugandská železnica, bežali priamo k pobrežiu.
V týchto nových krajinách tiež chýbala výrobná infraštruktúra na pridanie hodnoty k ich surovinám. Keďže mnohé africké krajiny boli v obilnín a nerastných surovinách, nemohli sami spracovať tento tovar. Ich ekonomiky boli závislé od obchodu, a preto sa stali zraniteľnými. Boli tiež zablokovaní v cykloch závislosti od svojich bývalých európskych majstrov. Získali politické, nie hospodárske závislosti, a ako Kwame Nkrumah - prvé hlavné miesto minister a prezident Ghany - vedeli, že politická nezávislosť bez ekonomickej nezávislosti bola bezvýznamné.
Závislosť na energii
Nedostatok infraštruktúry tiež znamenal, že africké krajiny boli kvôli svojej energii závislé od západných ekonomík. Dokonca ani krajiny bohaté na ropu nemali rafinérie potrebné na premenu svojej ropy na benzín alebo vykurovací olej. Niektorí vodcovia, ako napríklad Kwame Nkrumah, sa to pokúsili napraviť prijatím rozsiahlych stavebných projektov, ako je napríklad projekt vodnej priehrady na rieke Volta. Priehrada dodávala toľko potrebnej elektriny, ale jej výstavba spôsobila, že Ghana bola ťažko zadlžená. Stavba si tiež vyžadovala premiestnenie desiatok tisíc Ghanaanov a prispela k podpore Nkrumahu v Ghane. V roku 1966 bol Nkrumah zvrhnutý.
Neskúsené vedenie
V Independence bolo niekoľko prezidentov Jomo Kenyatta, mal niekoľko desaťročí politickej skúsenosti, ale iné, napríklad Tanzánie Julius Nyerere, vstúpil do politického sporu tesne pred nezávislosťou. Výrazný nedostatok bol tiež vyškolený a skúsený v civilnom vedení. Dolné vrstvy koloniálnej vlády boli už dlho obsadené africkými subjektmi, ale vyššie rady boli vyhradené pre bielych úradníkov. Prechod na nezávislých národných dôstojníkov znamenal, že na všetkých úrovniach byrokracie existovali jednotlivci s minimálnym predchádzajúcim školením. V niektorých prípadoch to viedlo k inovácii, ale mnohé problémy, ktorým africké štáty čelia nezávislosti, boli často spojené s nedostatkom skúseného vedenia.
Nedostatok národnej identity
Hranice nových afrických krajín zostali tie, ktoré boli nakreslené v Európe počas OP Bojovať o Afriku bez ohľadu na etnické alebo sociálne prostredie v teréne. Subjekty týchto kolónií mali často veľa identít, ktoré prevyšovali ich zmysel pre bytie, napríklad ghanské alebo konžské. Koloniálne politiky, ktoré uprednostňovali jednu skupinu pred druhou alebo ktoré „kmeňom“ prideľovali pôdu a politické práva, tieto rozpory prehĺbili. Najznámejším prípadom boli belgické politiky, ktoré vykryštalizovali rozdiely medzi Hutusom a Tutsisom vo Rwande, ktoré viedli v roku 1994 k tragickej genocíde.
Ihneď po dekolonizácii sa nové africké štáty dohodli na politike nedotknuteľných hraníc, čo znamená, že by sa nepokúsili prekresliť africkú politickú mapu, čo by viedlo k chaosu. Lídri týchto krajín tak zostali výzvou pokúsiť sa vytvoriť si pocit národnej identity v čase, keď tí, ktorí sa snažili o účasť v novej krajine, často hrali s regionálnymi alebo etnickými jednotlivcami lojality.
Studená vojna
Dekolonizácia sa napokon časovo zhodovala so studenou vojnou, ktorá pre africké štáty predstavovala ďalšiu výzvu. Násilie medzi Spojenými štátmi a Zväzom sovietskych socialistických republík (ZSSR) vyvolalo nesúlad a ťažké, ak nie nemožné, možnosť a tí vodcovia, ktorí sa pokúsili vyrezať tretí spôsob, všeobecne zistili, že musia ísť boky.
Politika studenej vojny tiež predstavovala príležitosť pre frakcie, ktoré sa snažili napadnúť nové vlády. V Angole viedla medzinárodná podpora, ktorú získali vlády a povstalecké frakcie počas studenej vojny, k občianskej vojne, ktorá trvala takmer tridsať rokov.
Tieto kombinované výzvy sťažili vytvorenie silnej ekonomiky alebo politickej stability v roku 2007 Afrika a prispela k otrasom, ktorým mnohé štáty (ale nie všetky!) Čelili v období medzi 60. a 60. rokmi neskoré 90. roky.