Vakuum je a bunková organela nachádza sa v rade rôznych typov buniek. Vakuoly sú tekutinou vyplnené uzavreté štruktúry, ktoré sú oddelené od cytoplazma pomocou jedinej membrány. Nachádzajú sa väčšinou v rastlinné bunky a huby. Avšak, niektoré prvoky, živočíšne bunkya baktérie obsahujú tiež vakuoly. Vacuoly sú zodpovedné za celý rad dôležitých funkcií v bunke vrátane skladovania živín, detoxikácie a exportu odpadu.
Vápno rastlinných buniek je obklopené jednou membránou nazývanou tonoplast. Keď sa vezikuly uvoľnia, vytvoria sa vákua endoplazmatické retikulum a Golgiho komplex, zlúčiť sa spolu. Novo sa vyvíjajúce rastlinné bunky typicky obsahujú niekoľko menších vakuol. Keď bunka dozrieva, vzniká fúziou menších vakuol veľká centrálna vakuola. Centrálna vakuola môže zaberať až 90% objemu bunky.
Rastlinné vakuoly fungujú podobne v rastlinách ako lysozomy v živočíšnych bunkách. Lyzozómy sú membránové vaky enzýmov, ktoré trávia bunkové makromolekuly. Zúčastňujú sa na ňom aj vákuové a lyzozómy programovaná bunková smrť
. K programovanej bunkovej smrti v rastlinách dochádza procesom nazývaným autolýza (Auto-lýza). Autolýza rastlín je prirodzene sa vyskytujúci proces, pri ktorom sa rastlinná bunka ničí svojimi vlastnými enzýmami. V usporiadanej sérii udalostí sa vakuolónový tonoplast pretrhne a uvoľní jeho obsah do cytoplazmy buniek. Tráviace enzýmy z vakuoly potom degradujú celú bunku.