Podmienky, ktoré zajali vojaci Únie, vydržali v Konfederácii Väznica v Andersonville boli strašné. Počas 18 mesiacov, keď bolo väzenie v prevádzke, zomrelo takmer 13 000 vojakov Únie podvýživa, choroba a vystavenie živlu živelníkovi v dôsledku neľudského zaobchádzania s veliteľom Andersonville Henry Wirz. Naozaj by nemalo byť prekvapením, že jeho stíhanie za vojnové zločiny po odovzdaní Juhu je najznámejší súdny proces vyplývajúci z Občianska vojna. Nie je však všeobecne známe, že konfederátov bolo takmer tisíc ďalších vojenských stíhaní. Mnohé z nich boli spôsobené zlým zaobchádzaním so zajatými vojakmi Únie.
Henry Wirz
Henry Wirz prevzal velenie nad väznicou Andersonville 27. marca 1864, asi mesiac po tom, čo tam dorazili prví väzni. Jedným z prvých Wirzových činov bolo vytvorenie priestoru nazývaného plot s pevnou čiarou, ktorý bol navrhnutý tak, aby zvyšoval bezpečnosť tým, že väzňov nebude držať v blízkosti múry palisády. Každý väzeň, ktorý prekročil „konečnú lehotu“, bol zastrelený väzenskými hliadkami. Počas Wirzovej vlády ako veliteľ využíval vyhrážky, aby držal väzňov v rade. Keď sa nezdalo, že hrozby nefungujú, Wirz prikázal strážnym strieľať väzňov. v
Máj 1865Wirz bol zatknutý v Andersonville a prevezený do Washington DC. čakať na súd. Wirz bol súdený za sprisahanie, aby zranil a / alebo zabil zajatých vojakov neoprávneným odmietnutím prístupu k jedlu, zdravotníckym pomôckam a odevom. Bol tiež obvinený z vraždy za osobné popravy mnohých väzňov.Približne 150 svedkov svedčilo proti Wirzovi počas jeho vojenského procesu, ktorý trval od 23. augusta do 18. októbra 1865. Po tom, ako bol Wirz uznaný vinným zo všetkých obvinení proti nemu, bol 10. novembra 1865 odsúdený na trest smrti.
James Duncan
James Duncan bol ďalším dôstojníkom väznice v Andersonville, ktorý bol tiež zatknutý. Duncan, ktorý bol pridelený do úradu štvrtinovej vlády, bol odsúdený za zabitie za úmyselné zadržiavanie jedla od väzňov. Bol odsúdený na 15 rokov tvrdej práce, ale po výkone jedného roka odňatia slobody unikol.
Champ Ferguson
Na začiatku občianskej vojny bol Champ Ferguson farmárom vo východnej Tennessee. Obyvateľstvo tejto oblasti bolo pomerne rovnomerne rozdelené medzi podporu Únie a Konfederácie. Ferguson zorganizoval partizánsku spoločnosť, ktorá zaútočila a zabila sympatizantov Únie. Ferguson tiež pôsobil ako skaut pre plukovníka Kentucky jazdectvo Johna Hunta Morganaa Morgan povýšil Fergusona na hodnosť kapitána partizánskych Rangers. Kongres konfederácie prijal opatrenie s názvom Akt partizánskeho strážcu, ktorý umožňoval nábor nepravidelných osôb do služby. Je potrebné poznamenať, že z dôvodu nedostatku disciplíny medzi partizánskymi Rangers, generál Robert E. závetrie vyzval na zrušenie aktu Konfederačným kongresom vo februári 1864. Po súdnom konaní pred vojenským tribunálom bol Ferguson odsúdený za zabitie viac ako 50 zajatých vojakov Únie. Bol popravený obesením v októbri 1865.
Robert Kennedy
Robert Kennedy bol dôstojníkom Konfederácie, ktorého zajali sily Únie a bol uväznený vo vojenskej väznici na ostrove Johnson Island. Väznica bola umiestnená v Sandusky Bay, ktorá je na pobreží jazera Erie len pár kilometrov od Sandusky v štáte Ohio. Kennedy utiekol z Johnsonovho ostrova v októbri 1864 a prešiel do Kanady - čo si udržalo neutralitu na oboch stranách. Kennedy sa stretol s niekoľkými konfederátnymi dôstojníkmi, ktorí využívali Kanadu ako odpaľovacie zariadenie na vedenie vojenských činov proti Únii. Zúčastnil sa sprisahania, aby začal požiare v mnohých hoteloch, ako aj v múzeu a divadle v New Yorku so zámerom premôcť miestne úrady. Všetky požiare boli buď rýchlo vyhasnuté, alebo nedokázali spôsobiť žiadne škody. Kennedy bol jediný, kto bol zajatý. Po súdnom konaní pred vojenským tribunálom bol Kennedy popravený zavesením v marci 1865.