Vodné spoločenstvá sú hlavné vodné biotopy na svete. Páči sa mi to pôdne biomy, vodné spoločenstvá možno ďalej rozdeliť na základe spoločných charakteristík. Dve bežné označenia sú sladkovodné a morské spoločenstvá.
Sladkovodné spoločenstvá
Rieky a potoky sú vodné útvary, ktoré sa neustále pohybujú jedným smerom. Obe sú rýchlo sa meniace komunity. Zdroj rieky alebo potoka sa zvyčajne výrazne líši od bodu, v ktorom sa rieka alebo potok vyprázdňuje. V týchto sladkovodných spoločenstvách sa nachádzajú rôzne rastliny a zvieratá vrátane pstruhov, riasy, sinice, hubya samozrejme rôzne druhy rýb.
ústie sú oblasti, kde sladkovodné toky alebo rieky narážajú na oceán. Tieto vysoko produktívne regióny obsahujú veľmi rozmanitý život rastlín a zvierat. Rieka alebo potok obvykle nesie veľa živín z vnútrozemských zdrojov, vďaka čomu sú ústí riek schopné podporovať túto bohatú rozmanitosť a vysokú produktivitu. Ústí riek je miestom kŕmenia a chovu rôznych zvierat vrátane vodného vtáctva, plazy, cicavcea obojživelníky.
Jazerá a jazierka sú stojatými vodnými plochami. Veľa potokov a riek končí v jazerách a rybníkoch. Fytoplanktón sa zvyčajne nachádza v horných vrstvách. Pretože svetlo je absorbované iba do určitých hĺbok, fotosyntéza je bežné iba v horných vrstvách. Jazerá a jazierka tiež podporujú celý rad rastlín a živočíchov, vrátane malých rýb, kreviet v slanom náleve, vodného hmyzu a mnohých druhov rastlín.
Morské spoločenstvá
oceány pokrývajú približne 70% zemského povrchu. Morské spoločenstvá je ťažké rozdeliť na rôzne typy, ale možno ich klasifikovať na základe stupňa prenikania svetla. Najjednoduchšia klasifikácia pozostáva z dvoch rôznych zón: photic a aphotic zóny. Fotická zóna je svetelná zóna alebo oblasť od hladiny vody do hĺbok, v ktorých je intenzita svetla iba okolo 1 percenta intenzity svetla na povrchu. V tejto zóne sa vyskytuje fotosyntéza. Prevažná väčšina morského života existuje vo photickej zóne. Aphotická zóna je oblasť, ktorá dostáva malé alebo žiadne slnečné svetlo. Prostredie v tejto zóne je mimoriadne tmavé a studené. Organizmy, ktoré žijú v apotickej zóne, sú často bioluminiscenčné alebo extrémofilné a zběhlé v extrémnych prostrediach. Rovnako ako v iných komunitách žije v oceáne celý rad organizmov. Niektoré zahŕňajú huby, špongie, hviezdica, morské sasanky, ryby, krabi, dinoflageláty, zelené riasy, morské cicavcea obrovská řasa.