Aby sa rôzne druhy mohli odkloniť od bežných predkov a riadenia vývoj, musí dôjsť k reprodukčnej izolácii. Existuje niekoľko druhov reprodukčnej izolácie, ktorá vedie k špecializácii. Jednou z najbežnejších metód je prezygotická izolácia, ktorá sa uskutoční pred tým, ako dôjde k oplodneniu gaméty a zabraňuje iným druhom sexuálne sa reprodukujúce. V zásade, ak jednotlivci nemôžu reprodukovať, považujú sa za odlišných druh a odchýliť sa na strome života.
Existuje niekoľko typov prezygotickej izolácie, ktorá siaha od nekompatibility gamét k správaniu ktoré vedú k nekompatibilite a dokonca k typu izolácie, z ktorej jednotlivci fyzicky bránia chov.
Mechanická izolácia - nekompatibilita sexuálnych orgánov - je pravdepodobne najjednoduchší spôsob, ako zabrániť jednotlivcom v reprodukcii medzi sebou. Či už je to tvar reprodukčných orgánov, umiestnenie alebo rozdiely vo veľkosti zakázať jednotlivcom spájať sa, keď sa pohlavné orgány nezmestia, párenie nie je pravdepodobné prihodiť sa.
V rastlinách funguje mechanická izolácia trochu inak. Pretože veľkosť a tvar nie sú pre rozmnožovanie rastlín irelevantné, mechanická izolácia je zvyčajne výsledkom použitia iného opeľovača pre rastliny. Napríklad závod, ktorý je štruktúrovaný
opeľovanie včiel nebude kompatibilný s kvetmi, ktoré sa naň spoliehajú kolibríky šíriť peľ. Aj keď je to stále výsledkom odlišných tvarov, nezáleží na tvare skutočných gamét, ale skôr na nekompatibilite tvaru kvetu a opeľovača.Rôzne druhy majú tendenciu mať rôzne obdobia rozmnožovania. Načasovanie cyklov plodnosti žien môže viesť k časovej izolácii. Podobné druhy môžu byť fyzicky kompatibilné, stále sa však nemôžu rozmnožovať kvôli obdobiu párenia v rôznych ročných obdobiach. Ak sú samice jedného druhu počas daného mesiaca plodné, ale samce nie sú schopné v tom istom roku roka sa rozmnožovať, môže to viesť k reprodukčnej izolácii medzi týmito dvoma druhmi.
Obdobia párenia veľmi podobných druhov sa niekedy trochu prekrývajú. Platí to najmä v prípade, ak druh žije v rôznych oblastiach a nenecháva hybridizáciu žiadnu šancu. Ukázalo sa však, že podobné druhy, ktoré žijú v tej istej oblasti, spravidla nemajú fázy prekrývania párenia, aj keď sa vyskytujú v odlišných prostrediach. S najväčšou pravdepodobnosťou ide o adaptačnú povahu navrhnutú na zníženie súťaže o zdroje a kamarátov.
Ďalší typ prezygotickej izolácie medzi druhmi súvisí so správaním jednotlivcov, a najmä so správaním okolo času párenia. Aj keď dve populácie rôznych druhov sú mechanicky a časovo kompatibilné, ich skutočné párenie rituálneho správania by mohlo stačiť na to, aby sa druh udržal v reprodukčnej izolácii od jedného ďalší.
Rituály párenia, spolu s ďalšími nevyhnutnými spôsobmi párenia - napríklad párenie hovorov a tancov - sú veľmi dôležité pre mužov a ženy rovnakého druhu, aby naznačili, že je čas rozmnožovať sa. Ak je páriaci rituál odmietnutý alebo nie je rozpoznaný, potom sa nevyskytuje párenie a druh sa bude reprodukovať jeden od druhého.
Napríklad, modrooký booby vták má veľmi prepracovaný páriaci tanec, ktorý musia muži vykonať, aby ohromili samicu. Samica buď akceptuje alebo odmietne zálohy samca, iné druhy vtákov, ktoré to samé nemajú Samica tanec úplne ignoruje - to znamená, že nemá šancu sa rozmnožiť s modrohnedou samičkou ťulpas.
Aj veľmi blízko príbuzné druhy majú preferencie, pokiaľ ide o to, kde žijú a kde sa rozmnožujú. Niekedy sú tieto preferované miesta pre reprodukčné udalosti medzi druhmi nekompatibilné, čo vedie k izolácii biotopov. Je zrejmé, že ak jednotlivci dvoch rôznych druhov nebudú bývať nikde blízko seba, nebude možné rozmnožovať sa. Tento typ reprodukčnej izolácie vedie k ešte väčšej špekulácii.
Avšak ani rôzne druhy, ktoré žijú na rovnakom mieste, nemusia byť kompatibilné kvôli svojmu preferovanému miestu rozmnožovania. Existujú vtáky, ktoré uprednostňujú určitý druh stromu alebo dokonca iné časti toho istého stromu, aby položili svoje vajcia a vytvorili si hniezda. Ak sa v tejto oblasti nachádzajú podobné druhy vtákov, vyberú si rôzne miesta a nebudú sa krížiť. Týmto sa druh udržuje oddelený a nemôže sa vzájomne rozmnožovať.
Gametická izolácia zaisťuje, že iba spermie toho istého druhu môžu preniknúť do vajíčka tohto druhu a žiadne iné. Počas sexuálnej reprodukcie je samičie vajíčko fúzované so samčími spermiami a spolu vytvárajú zygotu. Ak spermie a vajcia nie sú kompatibilné, nemôže dôjsť k oplodneniu. Vďaka niektorým chemickým signálom, ktoré uvoľňuje vajíčko, sa semeno nemusí priťahovať. Ďalším faktorom, ktorý bráni fúzii, je spermie, ktoré nemôžu vďaka svojmu chemickému zloženiu preniknúť do vajíčka. Ktorýkoľvek z týchto dôvodov je dostatočný na to, aby zmaril fúziu a zabránil tvorbe zygoty.
Tento typ reprodukčnej izolácie je zvlášť dôležitý pre druhy, ktoré sa množia zvonka vo vode. Napríklad samice väčšiny druhov rýb jednoducho vypustia svoje vajcia do vody podľa svojho preferovaného miesta rozmnožovania. Samce rýb tohto druhu potom prídu a uvoľnia spermie cez vajíčka, aby ich oplodnili. Pretože sa to však odohráva v tekutom prostredí, niektoré spermie sa odvedú molekulami vody a rozptýlia sa. Keby neexistovali žiadne gametické izolačné mechanizmy, akékoľvek spermie by sa mohli spojiť s akýmkoľvek vajíčkom, čo by viedlo k tomu, že by sa v tom čase párili vo vode hybridy akéhokoľvek druhu.